元享年間（1321～24）の創立。開山大経阿闍梨日輪。初め久成院と称し、崇安寺と号した。
　延宝年間に理境院妙浄日貞尼の寄進で堂宇を整備し理境院と改称。池上塔頭三院家の一。戦災で庫裡を焼失、昭和29年再建。宗祖自作、日輪感得とされる大黒天が、門前向側　（現在の宗務院の地）に祀られていたが、戦災で大黒堂が焼失、現在大黒天は本門寺長栄堂内に合祀されている。また本門寺常唱殿の日朝像は当寺より納めたという。本尊は台座下裏書によると、此尊像は元来西土教主阿彌陀悌とある（年代不祥）。しかし、寛保元年（1741）8月15日彼岸の時、通玄院日憲（34歳）が施主となり、師である長興長栄両山25世守玄院日顗聖人を点眼者として印契を造改し、三界独尊南無釋迦牟尼佛となられたと記されている（厨子には日顗聖人直筆の題目並に花押あり）。
　また、祖師像は台座の下書きによると慶應2年（1866）　谷中大雄寺の日観聖人が施主となり唐白檀にて彫刻され、同年11月18日、長興長栄両山60世妙慈院日運聖人によって開眼されたとある。
　なお当院の祖師像は当院17世十如院日因聖人の代、宝暦年間　（1751～1767）　に宗近なる者が、祖師の木像に御衣の施主となって寄進して以来、以後御衣を着するに至る。
　慶応3年、官軍の江戸城攻撃に際し西郷吉之助の宿舎となり、また明治11年には小学校校舎として堂宇を使用した。現在の池上小学校の前身である。
　28世舜是院日如は村松海長寺47世へ。
　47世大慈院日珖は片瀬龍口寺6世へ。
　境内庭園は一月から二月は梅花並に葉牡丹が美しく、裏庭池の錦鯉も見事。